Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms