Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms