Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AMBRA1Q9C0C7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AMBRA1Q9C0C7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AMBRA1Q9C0C7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AMBRA1Q9C0C7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AMBRA1Q9C0C7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms