Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSPO3Q9BXY4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSPO3Q9BXY4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSPO3Q9BXY4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSPO3Q9BXY4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSPO3Q9BXY4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RSPO3Q9BXY4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms