Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms