Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms