Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPIN2AQ99865 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms