Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms