Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL2Q969S2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEIL2Q969S2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms