Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRF4Q8WWF5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms