Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D1Q8WV19 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms