Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNX29Q8TEQ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms