Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCER1Q8TC90 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCER1Q8TC90 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms