Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP18Q8NEJ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms