Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLNKQ7Z7G1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLNKQ7Z7G1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms