Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APTXQ7Z2E3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms