Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST3Q7LGC8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST3Q7LGC8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms