Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms