Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms