Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIC2Q16515 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms