Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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