Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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