Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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