Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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