Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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