Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
STX4Q12846 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STX4Q12846 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms