Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

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Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNH2Q12809 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNH2Q12809 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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