Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms