Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLDN8P56748 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms