Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRATP43155 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRATP43155 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRATP43155 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRATP43155 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms