Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5F1P24539 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms