Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HNF1AP20823 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNF1AP20823 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms