Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD53P19397 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD53P19397 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD53P19397 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD53P19397 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD53P19397 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD53P19397 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD53P19397 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD53P19397 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD53P19397 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD53P19397 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms