Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms