Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms