Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms