Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA1P0DJI8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms