Protein–RNA interactions for Protein: P01569

IFNA5, Interferon alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA5P01569 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFNA5P01569 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA5P01569 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms