Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM3A6NDB9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms