Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms