Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23BQ9NYZ1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms