Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RNF185-206ENST00000494514 563 ntTSL 413.32□□□□□ -0.283e-18■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 RNF185-201ENST00000266252 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-18■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-18■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 RNF185-205ENST00000471384 3093 ntTSL 310.41□□□□□ -0.743e-18■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 RNF185-202ENST00000326132 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-18■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.274e-7■■■■■ 181.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.392e-9■■■■■ 181.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 181.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 181.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP5-207ENST00000554090 543 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 181.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP5-211ENST00000557643 872 ntTSL 39.88□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 181.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.412e-9■■■■■ 181.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 181.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.952e-9■■■■■ 181.5
UTP3Q9NQZ2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.656e-9■■■■■ 181.4
UTP3Q9NQZ2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.626e-9■■■■■ 181.4
UTP3Q9NQZ2 TAOK2-205ENST00000566552 2372 ntTSL 218.68■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 181.4
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-206ENST00000431016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.328e-8■■■■■ 181.3
UTP3Q9NQZ2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 181.3
UTP3Q9NQZ2 PRKRA-205ENST00000457633 942 ntTSL 323.67■■□□□ 1.382e-10■■■■■ 181.2
UTP3Q9NQZ2 PRKRA-202ENST00000424699 1616 ntTSL 223.09■■□□□ 1.292e-10■■■■■ 181.2
UTP3Q9NQZ2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-10■■■■■ 181.2
UTP3Q9NQZ2 PRKRA-207ENST00000463882 541 ntTSL 222.08■■□□□ 1.132e-10■■■■■ 181.2
UTP3Q9NQZ2 PRKRA-209ENST00000470200 550 ntTSL 419.45■□□□□ 0.72e-10■■■■■ 181.2
UTP3Q9NQZ2 PRKRA-208ENST00000466165 585 ntTSL 216.99■□□□□ 0.312e-10■■■■■ 181.2
UTP3Q9NQZ2 HCFC1-204ENST00000461098 379 ntTSL 512.5□□□□□ -0.412e-11■■■■■ 181.2
UTP3Q9NQZ2 PDE8A-206ENST00000557819 575 ntTSL 46.18□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 181.1
UTP3Q9NQZ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.251e-7■■■■■ 181.1
UTP3Q9NQZ2 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 181.1
UTP3Q9NQZ2 RPS6-202ENST00000380381 892 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 181.1
UTP3Q9NQZ2 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 181.1
UTP3Q9NQZ2 CDC42BPB-204ENST00000559043 1999 ntTSL 516.95■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 181.1
UTP3Q9NQZ2 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 181.1
UTP3Q9NQZ2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 181.1
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 410.41□□□□□ -0.749e-7■■■■■ 181
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.48□□□□□ -2.333e-57■■■■■ 181
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 181
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 181
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 181
UTP3Q9NQZ2 RNF145-204ENST00000518284 1940 ntTSL 212.29□□□□□ -0.441e-11■■■■■ 180.9
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 325.8■■□□□ 1.727e-7■■■■■ 180.7
UTP3Q9NQZ2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 180.6
UTP3Q9NQZ2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 180.6
UTP3Q9NQZ2 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 180.6
UTP3Q9NQZ2 NSL1-206ENST00000626725 790 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 180.6
UTP3Q9NQZ2 SRRM1-219ENST00000495561 563 ntTSL 29.29□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 180.4
UTP3Q9NQZ2 SRRM1-218ENST00000494934 802 ntTSL 38.86□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 180.4
UTP3Q9NQZ2 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 533.53■■■□□ 2.961e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.521e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 228.55■■■□□ 2.161e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 RNF126-205ENST00000591394 733 ntTSL 224.1■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 219.93■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 AGTPBP1-202ENST00000357081 4393 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.941e-6■■■■■ 180.3
UTP3Q9NQZ2 GATAD2B-202ENST00000634401 867 ntTSL 517.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 180.2
UTP3Q9NQZ2 GATAD2B-210ENST00000637331 145 ntTSL 514.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 180.2
UTP3Q9NQZ2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 180.2
UTP3Q9NQZ2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 180.2
UTP3Q9NQZ2 HACE1-210ENST00000519645 859 ntTSL 525.31■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.458e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.671e-10■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.65e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.465e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-207ENST00000555608 644 ntTSL 215.87■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-212ENST00000556639 2326 ntTSL 515.06■□□□□ 05e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 ZC3H18-205ENST00000564341 387 ntTSL 514.64□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 DDI2-201ENST00000320153 2076 ntTSL 212.49□□□□□ -0.413e-11■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 PTPN7-201ENST00000309017 3765 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.485e-11■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-201ENST00000316738 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.525e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-215ENST00000523357 874 ntTSL 310.37□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 39.4□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-203ENST00000550103 647 ntTSL 39.34□□□□□ -0.915e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-203ENST00000517975 680 ntTSL 37.74□□□□□ -1.178e-7■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-213ENST00000557685 698 ntTSL 37.68□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-216ENST00000492782 711 ntTSL 27.12□□□□□ -1.278e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-204ENST00000553871 624 ntTSL 56.37□□□□□ -1.395e-8■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 R3HDM2-208ENST00000448732 195 ntTSL 1 (best)24.56■■□□□ 1.521e-7■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.65e-6■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.15e-6■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 UXS1-206ENST00000441952 570 ntTSL 219.66■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 180.1
UTP3Q9NQZ2 CEP95-209ENST00000579860 895 ntTSL 515.52■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 180
UTP3Q9NQZ2 CEP95-210ENST00000580188 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 180
UTP3Q9NQZ2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 180
UTP3Q9NQZ2 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 180
UTP3Q9NQZ2 FHIT-204ENST00000468189 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 180
UTP3Q9NQZ2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 179.9
UTP3Q9NQZ2 CDC42BPA-208ENST00000442054 3786 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 179.9
UTP3Q9NQZ2 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 179.9
UTP3Q9NQZ2 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 29.52□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 179.9
UTP3Q9NQZ2 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 179.9
UTP3Q9NQZ2 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 179.7
UTP3Q9NQZ2 ZRANB3-205ENST00000452187 1269 ntTSL 511.31□□□□□ -0.68e-12■■■■■ 179.7
UTP3Q9NQZ2 ZRANB3-208ENST00000492193 546 ntTSL 39.81□□□□□ -0.848e-12■■■■■ 179.7
UTP3Q9NQZ2 ATP11C-209ENST00000485626 643 ntTSL 59.18□□□□□ -0.944e-8■■■■■ 179.7
UTP3Q9NQZ2 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.998e-12■■■■■ 179.7
UTP3Q9NQZ2 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.058e-12■■■■■ 179.7
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