Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms