Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms