Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms