Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms