Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNPDA2Q8TDQ7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms