Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms