Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1FOOQ8IZA3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms