Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms